Heiko Wandler studierte Musikwissenschaft, Soziologie, Philosophie, Multimedia und Musikinformatik an der Hochschule für Musik Karlsruhe und an der Universität Karlsruhe. In seiner Promotion an der Hochschule für Musik Karlsruhe befasste er sich mit den Wechselwirkungen zwischen Musiktechnologie und Klangästhetik in der Populären Musik.
Danach folgte von 2009 bis 2022 eine Beschäftigung als Studiengangsmanager und Studiengangsleiter an der Popakademie Baden-Württemberg. An der Popakademie erhielt er 2014 eine Professur und dort ist er weiterhin in der Lehre tätig.
Von 2022 bis 2025 war er Fortbildungskoordinator im Landesprogramm Kulturschule Baden-Württemberg.
An der Hochschule für Musik Karlsruhe ist Heiko Wandler seit 2018 Lehrbeauftragter und hier ist er seit 2025 als Wissenschafts- und Studiengangskoordinator am Institut für Musikinformatik und Musikwissenschaft angestellt.
Seine Lehr- und Forschungsschwerpunkte liegen in den Bereichen Geschichte, Ästhetik und Analyse der Populären Musik, Klangsynthese, Musiktechnologie, Popular Music Studies, Rhythmik und elektronische Musikproduktion.